Новый тест повышает способность прогнозировать риск развития рака шейки матки

Ученые разработали HPV RNA-Seq — новую методику молекулярной диагностики вне живого организма. Она необходима для выявления инфекции ВПЧ высокого риска и идентификации пациентов с плоскоклеточными внутриэпителиальными поражениями высокого уровня, то есть с предраковой стадией шейки матки. HPV RNA-Seq — это тест, сочетающий в себе преимущества молекулярных анализов и цитологию шейки матки.

Скрининг рака шейки матки позволяет выявлять и лечить предраковые поражения до развития рака. В настоящее время скрининг фокусируется или на тестировании на ВПЧ или на выявлении аномальных клеток шейки матки с цитологическим анализом. Но молекулярные диагностические тесты плохо выявляют рак или предраковые поражения. В исследовании HPV RNA-Seqиспользовался для анализа образцов 55 пациентов, 28 с плоскоклеточными интраэпителиальными поражениями низкой степени и 27 пациентов с предраковой стадией.

HPV RNA-Seq обнаруживала и определяла тип инфекции ВПЧ среди 16 групп высокого риска, результаты которых сопоставимы с широко используемым и официально одобренным набором для молекулярной диагностики. HPV RNA-Seq также обнаружила еще двух ВПЧ-позитивных пациентов и выявила много пациентов с множественными инфекциями ВПЧ. Было обнаружено, что тест имеет чувствительность (способность обнаруживать присутствие ВПЧ) 97,3% и отрицательную прогностическую ценность (вероятность отсутствия ВПЧ) 93,8%.

Выше было написано, что HPV RNA-Seq сочетает в себе преимущества молекулярных анализов и цитологии. Скажем об этом отдельно и начнем с молекулярного анализа. HPV RNA-Seqоснована на двойной комбинации мультиплексной полимеразной цепной реакции(ПЦР) с обратной транскрипцией и секвенирования следующего поколения(ССП). ПЦР — чувствительный способ измерения небольших количеств РНК, генетического материала, отражающего активность генов ВПЧ, а ССП позволяет точно охарактеризовать разнообразие амплифицированных вирусных последовательностей. Это позволяет обнаружить до 16 ВПЧ высокого или предполагаемого высокого риска в пробе, а также наличие предраковых маркеров.

А теперь о цитологии. Цитология используется в качестве быстрого метода для сортировки пациентов с ВПЧ, тогда как гистология считается золотым стандартом для диагностики рака шейки матки. Но гистологический анализ более инвазивен и требует больше времени для получения результатов. Чтобы определить, имеет ли новый тест место в сортировке рака шейки матки, исследователи сравнили цитологический анализ с HPV RNA-Seq и обнаружили маркеры высококачественной цитологии с обнадеживающими диагностическими показателями HPV RNA-Seqв качестве теста на сортировку. Они также обнаружили, что положительная прогностическая ценность HPV RNA-Seq по сравнению с гистологией была выше.

Когда технология позволит одновременно запускать несколько образцов, стоимость тестов снизится и станет от 10 до 20 долларов за раз. Тест также может быть применим для других видов рака, связанных с ВПЧ, таких как рак анального отверстия, головы и шеи.