Сейчас в клеточных исследованиях активно развивается метод флуоресцентного биоимиджинга. Он помогает визуализировать процессы в живых клетках и тканях в реальном времени. Недавно команда химиков и биологов СПбГУ разработали реагенты на основе гетероциклоалкинов, которые позволят присоединять флуоресцентные метки к биомолекулам надёжно и безопасно.
Для успешного биоимиджинга необходимо надёжно «сшить» флуоресцентные метки и биомолекулы. Для этого широко используются реакции SPAAC, которые позволяют присоединять реагенты циклоалкины с флуоресцентными метками к модифицированным азидными группами биполимерным молекулам непосредственно внутри клеток.
Учёным СПбГУ удалось синтезировать принципиально новые реагенты, которые отличаются от аналогов легкодоступностью и оптимальным балансом между реакционной способностью SPAAC и стабильностью. Вещества создавались в несколько этапов. Сначала исследователи создали метод синтеза циклоалкинов, с помощью которого были произведены молекулы с разным размером цикла (от восьми до десяти атомов) и структурными элементами, которые важны для регулировки баланса между активностью и стабильностью.
Затем были проведены кинетические исследования и квантовые химические расчёты устойчивости и реакционной способности получившихся соединений. Так учёные смогли выявить неклассическую реакционную способность соединений с циклами в девять атомов.
«Обычно чем больше цикл, тем меньше реакционная способность и больше стабильность соединений. В нашем случае стабильность действительно отличалась: с восьмичленными циклами было невозможно работать из-за их неустойчивости, а девятичленные оказались стабильными. А вот реакционная способность восьмичленных и девятичленных циклов при этом была практически одинаковой», — поясняет исследовательница.Команда учёных отметила, что девятиатомные гетероциклоалкины — самая подходящая группа для SPAAC. В настоящее время учёные работают над совершенствованием веществ и планируют получить патент на разработку.
«Сейчас для того, чтобы в клетке прошла реакция с использованием наших реагентов, требуется восемь часов. Мы стремимся довести эту реакционную способность до 15 минут. Проверяем все возможные варианты структур с улучшенной реакционной способностью при сохранении стабильности. Ищем наиболее эффективную молекулу. Также подбираем оптимальные пути связывания реагентов с флуоресцентными красителями и другими группами», — отмечает Наталья Данилкина.Фото: СПбГУ
Это новость от журнала ММ «Машины и механизмы». Не знаете такого? Приглашаем прямо сейчас познакомиться с этим удивительным журналом.