Исследователи из Университета Южной Калифорнии разработали новый, более оптимальный способ идентификации вариаций ДНК, ответственных за генетические изменения, которые влияют на функционирование клеток и развитие заболеваний.
Учёные рассматривали так называемые VNTR-последовательности — участки ДНК с повторяющимися последовательностями нуклеотидов. Они составляют всего 3%, однако при этом несут важную функцию — отвечают за кодирование некоторых генов, а также контролируют, какое количество белков будет производиться в клетках.
В настоящее время точных и эффективных методов наблюдения изменений в VNTR-последовательностях просто не существует. Именно поэтому калифорнийские учёные создали новый метод поиска таких изменений. Он представляет собой программное обеспечение, анализирующее пангеномы — совокупность всех генов той или иной группы организмов. Софт, созданный учёными, определяет разнообразие и повторы VNTR-последовательностей в хромосомах.
«Этот тип повторения ДНК всегда считался «тёмной материей» человеческого генома, так как его было сложно выявлять и анализировать. Наш метод показывает, что вариации у этих последовательностях могут существенно влиять на клеточные процессы. В дальнейшем наш метод может использоваться для выявления генетической природы заболеваний, а также при поиске способов их лечения», — отметил один из авторов исследования, профессор количественной и вычислительной биологии Марк Чейссон.Это новость от журнала ММ «Машины и механизмы». Не знаете такого? Приглашаем прямо сейчас познакомиться с этим удивительным журналом.