С момента своего появления технология CRISPR использовалась для редактирования генома только одного типа клеток за раз. С помощью CRISPR можно было вырезать, удалять и добавлять гены в конкретном типе клеток ткани или органа. Недавно учёные из Калифорнийского университета в Беркли, которые и разработали технологию, совершили прорыв в её применении. Теперь CRISPR можно использовать для редактирования генов одновременно нескольких типов клеток.
Возможность одновременной вставки или удаления генов в клетках разных типов может пригодиться как для выращивания клеточных культур в биореакторах, так и в исследованиях структур комплексных бактерий, архей или грибов. Дополненная технология CRISPR поможет отслеживать распространение определённых генов в популяциях этих организмов.
CRISPR был усовершенствован с учётом достижений метагеномики — методологической области, направленной на создание технологий секвенирования ДНК целых сообществ микроорганизмов, а не каждого из них по отдельности.
Учёные разработали особый метод, называемый ET-seq (environmental transformation sequencing, секвенирование средовых трансформаций). Он позволяет использовать так называемые «прыгающие гены», или транспозоны — участки ДНК, способные к передвижению и размножению в пределах генома — для понимания геномной картины популяции микроорганизмов. CRISPR даёт возможность вводить транспозоны в микробов, чтобы понять, насколько различные их виды пригодны для редактирования. Такой подход предоставляет возможность редактировать геном бактериальных и микробных сообществ.
Фото: UC Berkeley
Это новость от журнала ММ «Машины и механизмы». Не знаете такого? Приглашаем прямо сейчас познакомиться с этим удивительным журналом.