Биоинформатики из Сколтеха разработали новую архитектуру нейросети, которая поможет определить, насколько точно подобрана «гидовая» РНК при редактировании генов. Технология позволит усовершенствовать методы работы с молекулярными ножницами CRISPR/CAS.
Ключевыми элементами технологии генетического редактирования CRISPR являются «гидовые», или наводящие, РНК, а также белок Cas9, который разрезает ДНК в определённом участке. Однако наводящая РНК не всегда попадает в цель, а значит может неверно направить молекулярные ножницы.
Учёные Сколтеха решили исправить это, увеличив точность инструмента CRISPR/CAS за счёт глубокого обучения, гауссовских процессов и других методов. В результате была создана серия нейросетей, представляющих собой математические модели, реализованные в последовательном умножении матриц. Нейросеть способна обучаться: в тренировочном режиме её память изменяется с учётом вводных данных.
Это позволяет новому алгоритму оценивать вероятности разреза ДНК-мишеней в правильных участках для гидовых РНК. Инструмент может применяться в любых технологиях, основанных на молекулярных ножницах CRISPR/CAS.
Фото: ITC
Это новость от журнала ММ «Машины и механизмы». Не знаете такого? Приглашаем прямо сейчас познакомиться с этим удивительным журналом.